花卉种类丰富，分类方法多样，主要依据生物学特性、园林用途和观赏特性。生物学特性分类包括草本花卉、水生花卉等。园林用途分类包括一、二年生露地花卉、盆花等。观赏特性分类则包括以花、叶、茎、果为主要观赏器官的花卉等。
花卉种类丰富，包括开花植物，甚至苔藓和蕨类植物。栽培应用方式也多样。因此，花卉的分类方法有很多，主要取决于分类的依据。这里列出了几种常用的分类方法。
-
根据生物学特性进行分类，这是一种综合分类法，主要依据花卉的生态习性、生物学特性、栽培方式、应用类型等进行分类。这是目前园艺界公认的一种分类方法，它将所有的花卉分为：草本花卉、水生花卉、仙人掌及多浆多肉植物类、草坪及地被植物、花木类等。
-
根据园林用途分类，例如可以用于布置花坛的一、二年生露地花卉，可以以盆栽形式装饰室内及庭园的盆花，适合室内摆放的一类花卉，切花花卉，以及在园林设计中，亭台树荫下生长的花卉等。
-
根据观赏特性（器官）分类，主要是以观赏植物的主要观赏器官作为分类依据。例如，以花作为主要观赏器官的花类，以叶作为主要观赏器官的观叶类，茎体态奇特，颇具观赏性、趣味性的观茎类，以果型、果色、大小等较为奇特的观果类，花具有香气的芳香类，以及包括庇荫树和行道树的荫木类，适于片植、群植形成风景林的林木类等。
