盆栽果树的养护需要注意适度施肥，采取“薄肥勤施、少量多次”的策略，且施肥的浓度和量应适中以避免根系腐烂。基肥主要通过更换营养土实现，不同果树的营养土配法有差异。每日浇水量应随季节和气候变化，冬季、春季和晚秋保持盆土湿润，夏季高温时要浇透。施肥应避免围绕根颈，以免烧伤果树根颈。有机肥必须充分腐熟后施用，否则会伤害根系。
盆栽果树的土壤容积有限，受常浇水和肥料淋溶损失影响，因此，每次施肥的量应控制适中。考虑到盆的四周都接触空气，温度易受气温影响而偏高，有机质分解较快，肥料的持效期较短。因此，对盆栽果树的施肥策略通常是“薄肥勤施、少量多次”。先将充分腐熟的有机肥制成液肥，如豆饼、鱼肚、变质的蛋品、牛奶等，收集一起发酵后加水稀释（200倍），随生长季节补充。特别是在春梢生长和果实膨大期，每7～10天应补施一次稀液肥。
盆栽果树的基肥主要通过更换营养土实现，一般每年落叶后至发芽前更换一次。营养土由壤土、炉灰土、草木灰和腐熟厩肥或腐叶土配成，不同果树的营养土配法也有差异。例如，盆栽葡萄和桃的营养土是壤土（园土）50%，沙30%，腐肥2%；柑桔的营养土为60%的壤土，20%的沙和20%的腐肥；盆栽苹果时营养土的配比为风化粘土40%，炉灰40%，腐肥10%和草木灰10%；银杏则用60%的壤土，20%的沙土和20%的腐叶土等。
每日浇水是盆栽果树的特点，浇水量应随季节和气候而变化。在冬季、春季和晚秋，应保持盆土湿润；在夏季高温时，要浇透，并在雨后也要浇水。浇水时应避免过急和过量。春秋季浇水时间为上午10时至下午3时；夏天在上午8时前或下午5时以后。休眠期一般每周浇水一次。浇灌用水以雨水、河水为佳，自来水或井水应储存一段时间后再用。
施肥应避免围绕根颈，因为根颈施肥不利于肥料吸收，容易烧伤果树根颈，影响正常生长，甚至造成果树死亡。正确的方法是，将无机肥料的水容液或无机肥施在花盆边的土中。
有机肥必须充分腐熟后施用，否则在花盆中发酵产生高温会伤害根系。通常不采用有机肥作追肥使用，而是在种植前配制营养土时加入充分腐熟的有机肥。
注意施肥的浓度和量。由于盆栽果树的根系集中在盆里，如果施肥浓度过大，或一次施肥量过多，会造成根系出现反渗透现象，甚至造成根系腐烂，果树植株死亡。因此，施肥应掌握“勤施薄肥、少量多次施肥”的原则。施用尿素、复合肥水容液的浓度控制在0.2-0.5%，每盆用量控制在1-2克为宜。
